Tomlab Blog

created: 2022-11-03

FASTQ

1:  @ID desc @で始まる以外は任意形式の行
2:  Sequence 1行又は複数行
3:  + 行頭の+でSEQ行終了。旧形式では+の後にID行を再掲する
4:  Quality Score 1行又は複数行, SEQと同数の文字数
Qsanger=-10log10p, ASCII code=Q+33
+や@もQulity Scoreであるため、
grep ^@ | wc -lは必ずしもエントリー数にならない